Я никогда не воспринимал Кремль Москвой. Совершенно иное пространство. Другое государство, вроде Ватикана.
Он даже пишется с большой буквы - как другой населенный пункт: зоопарк, консерватория, телебашня и Кремль. В других городах кремли пишутся с маленьких букв.